Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18533 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P18533 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18533 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18533 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18533 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P18533 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18533 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18533 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18533 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18533 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18533 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18533 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18533 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18533 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18533 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18533 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18533 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18533 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18533 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P18533 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18533 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P18533 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P18533 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18533 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18533 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18533 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18533 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18533 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18533 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18533 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18533 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18533 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18533 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18533 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18533 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18533 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18533 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18533 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18533 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18533 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
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