Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Il1r1-201ENSMUST00000027241 5819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Epn2-204ENSMUST00000108713 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Pde6a-201ENSMUST00000025468 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm10874-201ENSMUST00000100526 2355 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 A530021J07Rik-202ENSMUST00000207727 1406 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Ank3-203ENSMUST00000092431 5823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Pnpla1os-201ENSMUST00000146779 3946 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Amt-201ENSMUST00000035230 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Park2-209ENSMUST00000191124 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Vps39-201ENSMUST00000028752 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 CT572985.1-201ENSMUST00000220599 4714 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Kcnj5-202ENSMUST00000214223 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Cyp2c54-201ENSMUST00000048959 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Epb41-204ENSMUST00000105970 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Slc34a2-201ENSMUST00000094787 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Nrp2-205ENSMUST00000114155 6534 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Pip5k1a-201ENSMUST00000005768 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gpr63-201ENSMUST00000038920 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Ing5-201ENSMUST00000027505 4533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Mtor-202ENSMUST00000103221 8564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Myo1c-202ENSMUST00000102504 4659 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 P2rx1-202ENSMUST00000092938 1119 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Frmpd1-201ENSMUST00000044773 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm45847-201ENSMUST00000209402 1880 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Cd8a-201ENSMUST00000066747 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Zfp114-201ENSMUST00000086010 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Sptan1-203ENSMUST00000100225 7892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Luzp1-203ENSMUST00000105849 7438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Cpt1b-201ENSMUST00000109313 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms