Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Olfr1466-201ENSMUST00000075868 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Dcpp3-201ENSMUST00000115428 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 AC165260.4-201ENSMUST00000225924 724 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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