Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.7 ms