Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Taf4E9QAP7 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Taf4E9QAP7 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Taf4E9QAP7 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Taf4E9QAP7 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Taf4E9QAP7 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Taf4E9QAP7 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Taf4E9QAP7 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
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