Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Hdac5Q9Z2V6 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Hdac5Q9Z2V6 Msmb-201ENSMUST00000022464 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Hdac5Q9Z2V6 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Hdac5Q9Z2V6 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Hdac5Q9Z2V6 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Hdac5Q9Z2V6 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Hdac5Q9Z2V6 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Hdac5Q9Z2V6 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Hdac5Q9Z2V6 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Hdac5Q9Z2V6 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 4930595O18Rik-201ENSMUST00000205099 607 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms