Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ubl3Q9Z2M6 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms