Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBM0

Abcg8, ATP-binding cassette sub-family G member 8, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg8Q9DBM0 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcg8Q9DBM0 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcg8Q9DBM0 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcg8Q9DBM0 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcg8Q9DBM0 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcg8Q9DBM0 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcg8Q9DBM0 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcg8Q9DBM0 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcg8Q9DBM0 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcg8Q9DBM0 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcg8Q9DBM0 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcg8Q9DBM0 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcg8Q9DBM0 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcg8Q9DBM0 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcg8Q9DBM0 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcg8Q9DBM0 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcg8Q9DBM0 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcg8Q9DBM0 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcg8Q9DBM0 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcg8Q9DBM0 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcg8Q9DBM0 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcg8Q9DBM0 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcg8Q9DBM0 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcg8Q9DBM0 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcg8Q9DBM0 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcg8Q9DBM0 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcg8Q9DBM0 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcg8Q9DBM0 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcg8Q9DBM0 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcg8Q9DBM0 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcg8Q9DBM0 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcg8Q9DBM0 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcg8Q9DBM0 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Abcg8Q9DBM0 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms