Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Rassf9-202ENSMUST00000219445 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm45867-201ENSMUST00000208201 2317 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Rimbp2-201ENSMUST00000111346 4264 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Pde1c-204ENSMUST00000164752 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Tigd4-201ENSMUST00000062623 3459 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Srprb-201ENSMUST00000035157 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Rorb-202ENSMUST00000112828 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Fmo3-201ENSMUST00000028010 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 AC153498.1-201ENSMUST00000219775 2722 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm37032-201ENSMUST00000194882 2975 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Mapkap1-203ENSMUST00000113126 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 4833420G17Rik-201ENSMUST00000026519 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Tyw3-204ENSMUST00000170461 4270 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Mfn2-201ENSMUST00000030884 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Slc27a6-201ENSMUST00000025500 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 4932442E05Rik-201ENSMUST00000191892 2717 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm12592-201ENSMUST00000155332 2954 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm44510-201ENSMUST00000206288 4532 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Sncaip-203ENSMUST00000163742 3272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm40289-201ENSMUST00000201470 2268 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Platr9-202ENSMUST00000149572 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Pcdhgc5-201ENSMUST00000055935 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Cog5-201ENSMUST00000036862 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Pik3c3-202ENSMUST00000115811 3084 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Rbbp6-201ENSMUST00000052135 6184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Eno4-202ENSMUST00000200910 2567 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Eno4-201ENSMUST00000054280 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms