Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ufl1Q8CCJ3 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ufl1Q8CCJ3 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ufl1Q8CCJ3 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufl1Q8CCJ3 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufl1Q8CCJ3 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufl1Q8CCJ3 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufl1Q8CCJ3 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufl1Q8CCJ3 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufl1Q8CCJ3 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufl1Q8CCJ3 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufl1Q8CCJ3 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufl1Q8CCJ3 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufl1Q8CCJ3 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufl1Q8CCJ3 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufl1Q8CCJ3 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufl1Q8CCJ3 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufl1Q8CCJ3 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufl1Q8CCJ3 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufl1Q8CCJ3 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufl1Q8CCJ3 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufl1Q8CCJ3 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufl1Q8CCJ3 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufl1Q8CCJ3 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufl1Q8CCJ3 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufl1Q8CCJ3 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufl1Q8CCJ3 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufl1Q8CCJ3 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufl1Q8CCJ3 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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