Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Usp48Q3V0C5 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Usp48Q3V0C5 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Usp48Q3V0C5 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Usp48Q3V0C5 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
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Usp48Q3V0C5 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Usp48Q3V0C5 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Usp48Q3V0C5 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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