Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Pip5k1a-201ENSMUST00000005768 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm13140-201ENSMUST00000119840 3151 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Zscan21-203ENSMUST00000110959 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Slc45a3-202ENSMUST00000177943 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Wdr37-212ENSMUST00000176922 3780 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Atp1a3-202ENSMUST00000102858 3895 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Acer2-202ENSMUST00000084433 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Dcun1d4-201ENSMUST00000063882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Stra6-201ENSMUST00000034880 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Srpk1-204ENSMUST00000130643 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms