Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Rasgrp1-204ENSMUST00000173252 1750 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Ifne-201ENSMUST00000056014 664 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms