Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U6N9 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U6N9 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U6N9 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U6N9 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U6N9 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U6N9 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U6N9 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U6N9 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U6N9 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U6N9 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
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