Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Pabpc5-202ENSMUST00000113366 2243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm44547-201ENSMUST00000207793 1446 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 H2-M10.4-201ENSMUST00000057502 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Oprk1-201ENSMUST00000027038 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Lypla1-203ENSMUST00000119612 529 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm14108-201ENSMUST00000122234 494 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm13372-201ENSMUST00000123129 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Pdc-201ENSMUST00000165062 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Mir6981-201ENSMUST00000184293 115 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Pou1f1-205ENSMUST00000184525 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 4930547H16Rik-201ENSMUST00000222281 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Rpl21-ps2-201ENSMUST00000222933 481 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 AC123698.1-201ENSMUST00000227090 402 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm44907-201ENSMUST00000207423 1633 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Supt20-ps-201ENSMUST00000117999 1560 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Pfkfb3-215ENSMUST00000183869 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Fcrla-203ENSMUST00000159171 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 0610037L13Rik-203ENSMUST00000106726 515 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm13303-201ENSMUST00000117125 1284 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm13002-201ENSMUST00000119286 682 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Banf2os-201ENSMUST00000124061 771 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm12221-201ENSMUST00000125096 1131 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm5191-201ENSMUST00000222882 1236 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Btn2a2-204ENSMUST00000223877 2109 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Krtap21-1-201ENSMUST00000078422 748 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gba-201ENSMUST00000077367 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Rhox4a-201ENSMUST00000115194 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm15661-201ENSMUST00000117390 556 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm17250-201ENSMUST00000180494 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm35299-201ENSMUST00000195865 421 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 CT025689.5-201ENSMUST00000224316 986 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm6378-201ENSMUST00000084199 444 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Sgca-201ENSMUST00000100551 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm42731-201ENSMUST00000201839 1641 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Msln-201ENSMUST00000075884 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Rhox3f-201ENSMUST00000115172 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm6141-201ENSMUST00000117181 695 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm13197-201ENSMUST00000117204 225 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm11231-201ENSMUST00000117895 1706 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm20467-201ENSMUST00000172872 994 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Rhox3f-203ENSMUST00000184451 1008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Ighv1-8-201ENSMUST00000192236 293 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Cryab-205ENSMUST00000216755 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms