Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms