Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Tmod1P49813 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
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Tmod1P49813 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Tmod1P49813 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Tmod1P49813 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Tmod1P49813 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Tmod1P49813 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
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Tmod1P49813 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
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