Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Cdkn1bP46414 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms