Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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RxraP28700 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RxraP28700 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxraP28700 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxraP28700 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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RxraP28700 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxraP28700 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxraP28700 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxraP28700 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxraP28700 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxraP28700 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxraP28700 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxraP28700 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RxraP28700 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxraP28700 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RxraP28700 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RxraP28700 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RxraP28700 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RxraP28700 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxraP28700 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxraP28700 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RxraP28700 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxraP28700 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxraP28700 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxraP28700 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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