Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Igf2bp3-201ENSMUST00000031838 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm7967-202ENSMUST00000191042 5042 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm29222-201ENSMUST00000185442 2167 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm29449-201ENSMUST00000187820 2168 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm28104-201ENSMUST00000188331 2168 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm28743-201ENSMUST00000189014 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm29384-201ENSMUST00000190852 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm37538-201ENSMUST00000192417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Cemip-201ENSMUST00000064174 7111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Cenpl-201ENSMUST00000028035 4883 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Nlrc5-207ENSMUST00000211816 7578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Il1r1-201ENSMUST00000027241 5819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm26865-201ENSMUST00000180970 3284 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Ralgps1-204ENSMUST00000113165 6192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Diablo-207ENSMUST00000145152 2588 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms