Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Pdzd7-202ENSMUST00000145391 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Itga10-202ENSMUST00000119365 5035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Has3-201ENSMUST00000034385 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Nfasc-202ENSMUST00000094569 9739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Tspan2-202ENSMUST00000119902 961 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Morc2a-201ENSMUST00000093389 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Nup214-201ENSMUST00000065398 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Olfr943-204ENSMUST00000213830 8305 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Tgfbi-201ENSMUST00000045173 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Olfr410-202ENSMUST00000213831 5070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Nr2c1-201ENSMUST00000092213 2376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Ankmy1-202ENSMUST00000160548 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Cc2d2a-201ENSMUST00000048150 5484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Itgal-203ENSMUST00000118405 3909 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm11426-201ENSMUST00000125600 2220 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm20705-201ENSMUST00000177278 1921 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Oc90-201ENSMUST00000060522 1909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Zfp532-208ENSMUST00000182852 5476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Thbs3-202ENSMUST00000119084 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Arhgap45-201ENSMUST00000043311 3499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Pkd1l2-202ENSMUST00000109093 7389 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Pkd1l2-201ENSMUST00000098375 7386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Pygm-202ENSMUST00000113483 2583 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Myadm-201ENSMUST00000096744 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Muc6-201ENSMUST00000062451 8650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms