Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Tpm1-213ENSMUST00000113697 1742 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm38014-201ENSMUST00000193349 2612 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm2035J3QP87 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm2035J3QP87 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm2035J3QP87 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm2035J3QP87 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm2035J3QP87 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm2035J3QP87 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm2035J3QP87 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm2035J3QP87 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm2035J3QP87 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm2035J3QP87 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm2035J3QP87 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm2035J3QP87 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm2035J3QP87 Gm8185-201ENSMUST00000160999 669 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm2035J3QP87 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm2035J3QP87 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm2035J3QP87 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm2035J3QP87 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm2035J3QP87 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm2035J3QP87 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm2035J3QP87 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm2035J3QP87 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms