Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gtf2i-222ENSMUST00000174354 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms