Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 4930432K21Rik-201ENSMUST00000093375 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Olfr73-202ENSMUST00000129056 3048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Btrc-206ENSMUST00000224102 3037 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 AC117656.2-201ENSMUST00000224931 2215 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Gm7103-201ENSMUST00000195642 1852 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Marveld2-204ENSMUST00000225754 3111 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf217D3YYI7 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms