Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Sncaip-201ENSMUST00000025413 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Rpap2-201ENSMUST00000065422 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Sgk3-204ENSMUST00000171265 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm44445-201ENSMUST00000204075 2683 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Atp8b5A3FIN4 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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