Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Rimbp2-202ENSMUST00000196085 3732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1350-203ENSMUST00000219278 1768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Gtf3c6Q9D8P7 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Gtf3c6Q9D8P7 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Gtf3c6Q9D8P7 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
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Gtf3c6Q9D8P7 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6562-201ENSMUST00000221903 464 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Gtf3c6Q9D8P7 Txk-206ENSMUST00000198464 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Gtf3c6Q9D8P7 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Gtf3c6Q9D8P7 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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