Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Bcl2l11-205ENSMUST00000110341 5036 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Nwd1-201ENSMUST00000093427 7840 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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