Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms