Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPS8

Small membrane A-kinase anchor protein, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CPS8 Zfp111-202ENSMUST00000073833 3079 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9CPS8 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9CPS8 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9CPS8 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9CPS8 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9CPS8 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CPS8 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Hnrnpk-216ENSMUST00000177019 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CPS8 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CPS8 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CPS8 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CPS8 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CPS8 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CPS8 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Gm37567-201ENSMUST00000193241 2279 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q9CPS8 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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