Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

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Length 938 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Hdac7Q8C2B3 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Hdac7Q8C2B3 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Hdac7Q8C2B3 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Hdac7Q8C2B3 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Hdac7Q8C2B3 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hdac7Q8C2B3 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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