Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SnupnQ80W37 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms