Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Usp48Q3V0C5 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Usp48Q3V0C5 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Usp48Q3V0C5 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Usp48Q3V0C5 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Usp48Q3V0C5 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Usp48Q3V0C5 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Usp48Q3V0C5 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Usp48Q3V0C5 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Usp48Q3V0C5 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Usp48Q3V0C5 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Usp48Q3V0C5 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
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