Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms