Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec24aQ3U2P1 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms