Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Kdm4dQ3U2K5 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms