Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms