Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

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Length 946 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn1P70268 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms