Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Itga11P61622 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itga11P61622 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itga11P61622 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Itga11P61622 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itga11P61622 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itga11P61622 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itga11P61622 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itga11P61622 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itga11P61622 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Itga11P61622 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itga11P61622 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itga11P61622 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itga11P61622 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itga11P61622 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itga11P61622 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Itga11P61622 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms