Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms