Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
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Tmod1P49813 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Tmod1P49813 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Tmod1P49813 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Tmod1P49813 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Tmod1P49813 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Tmod1P49813 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Tmod1P49813 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Tmod1P49813 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Tmod1P49813 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Tmod1P49813 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
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