Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P20040 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P20040 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P20040 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P20040 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P20040 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P20040 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P20040 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P20040 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P20040 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P20040 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P20040 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P20040 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P20040 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P20040 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P20040 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P20040 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P20040 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P20040 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
P20040 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P20040 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P20040 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P20040 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P20040 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
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P20040 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
P20040 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P20040 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P20040 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
P20040 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
P20040 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P20040 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P20040 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P20040 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P20040 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P20040 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P20040 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P20040 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P20040 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P20040 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P20040 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P20040 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P20040 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P20040 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P20040 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P20040 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P20040 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P20040 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
P20040 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P20040 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
P20040 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P20040 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
P20040 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P20040 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
P20040 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
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