Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P04213 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P04213 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P04213 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P04213 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P04213 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P04213 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P04213 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P04213 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P04213 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04213 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04213 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04213 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04213 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04213 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04213 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P04213 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04213 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04213 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04213 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04213 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04213 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04213 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04213 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04213 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P04213 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04213 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04213 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04213 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04213 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04213 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04213 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04213 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04213 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04213 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04213 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04213 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04213 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04213 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04213 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P04213 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P04213 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04213 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04213 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P04213 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04213 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P04213 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04213 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04213 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P04213 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P04213 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P04213 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P04213 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
P04213 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P04213 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P04213 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P04213 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P04213 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
P04213 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P04213 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P04213 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P04213 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P04213 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
P04213 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P04213 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P04213 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P04213 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P04213 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P04213 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P04213 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04213 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04213 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04213 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04213 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04213 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04213 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04213 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04213 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04213 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04213 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04213 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04213 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04213 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04213 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04213 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04213 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04213 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04213 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P04213 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04213 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04213 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04213 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04213 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P04213 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04213 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P04213 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04213 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04213 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04213 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P04213 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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