Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lnx1O70263 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms