Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Dcpp3-201ENSMUST00000115428 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Esd-ps-201ENSMUST00000170684 847 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.3 ms