Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm20834J3QM72 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms