Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1B8

Phf1, PHD finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf1Q9Z1B8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Phf1Q9Z1B8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf1Q9Z1B8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms