Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sh3bp5Q9Z131 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sh3bp5Q9Z131 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sh3bp5Q9Z131 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sh3bp5Q9Z131 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sh3bp5Q9Z131 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sh3bp5Q9Z131 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sh3bp5Q9Z131 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sh3bp5Q9Z131 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sh3bp5Q9Z131 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Sh3bp5Q9Z131 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sh3bp5Q9Z131 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sh3bp5Q9Z131 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sh3bp5Q9Z131 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sh3bp5Q9Z131 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sh3bp5Q9Z131 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sh3bp5Q9Z131 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sh3bp5Q9Z131 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sh3bp5Q9Z131 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sh3bp5Q9Z131 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sh3bp5Q9Z131 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sh3bp5Q9Z131 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Sh3bp5Q9Z131 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sh3bp5Q9Z131 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sh3bp5Q9Z131 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sh3bp5Q9Z131 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sh3bp5Q9Z131 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sh3bp5Q9Z131 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sh3bp5Q9Z131 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sh3bp5Q9Z131 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sh3bp5Q9Z131 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sh3bp5Q9Z131 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sh3bp5Q9Z131 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sh3bp5Q9Z131 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sh3bp5Q9Z131 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sh3bp5Q9Z131 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sh3bp5Q9Z131 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Sh3bp5Q9Z131 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sh3bp5Q9Z131 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sh3bp5Q9Z131 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sh3bp5Q9Z131 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sh3bp5Q9Z131 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sh3bp5Q9Z131 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sh3bp5Q9Z131 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sh3bp5Q9Z131 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms