Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ5

Tnni1, Troponin I, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni1Q9WUZ5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnni1Q9WUZ5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnni1Q9WUZ5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnni1Q9WUZ5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnni1Q9WUZ5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnni1Q9WUZ5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Tnni1Q9WUZ5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tnni1Q9WUZ5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnni1Q9WUZ5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tnni1Q9WUZ5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tnni1Q9WUZ5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnni1Q9WUZ5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnni1Q9WUZ5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnni1Q9WUZ5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tnni1Q9WUZ5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnni1Q9WUZ5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnni1Q9WUZ5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnni1Q9WUZ5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnni1Q9WUZ5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnni1Q9WUZ5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnni1Q9WUZ5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnni1Q9WUZ5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnni1Q9WUZ5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnni1Q9WUZ5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnni1Q9WUZ5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnni1Q9WUZ5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnni1Q9WUZ5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnni1Q9WUZ5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnni1Q9WUZ5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnni1Q9WUZ5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnni1Q9WUZ5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnni1Q9WUZ5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnni1Q9WUZ5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tnni1Q9WUZ5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnni1Q9WUZ5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnni1Q9WUZ5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnni1Q9WUZ5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnni1Q9WUZ5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnni1Q9WUZ5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnni1Q9WUZ5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnni1Q9WUZ5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Tnni1Q9WUZ5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tnni1Q9WUZ5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnni1Q9WUZ5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnni1Q9WUZ5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnni1Q9WUZ5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnni1Q9WUZ5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnni1Q9WUZ5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnni1Q9WUZ5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnni1Q9WUZ5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnni1Q9WUZ5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnni1Q9WUZ5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnni1Q9WUZ5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnni1Q9WUZ5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnni1Q9WUZ5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnni1Q9WUZ5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnni1Q9WUZ5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnni1Q9WUZ5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnni1Q9WUZ5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnni1Q9WUZ5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnni1Q9WUZ5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnni1Q9WUZ5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnni1Q9WUZ5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnni1Q9WUZ5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnni1Q9WUZ5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnni1Q9WUZ5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnni1Q9WUZ5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnni1Q9WUZ5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnni1Q9WUZ5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnni1Q9WUZ5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnni1Q9WUZ5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnni1Q9WUZ5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnni1Q9WUZ5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnni1Q9WUZ5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnni1Q9WUZ5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnni1Q9WUZ5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnni1Q9WUZ5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnni1Q9WUZ5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnni1Q9WUZ5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnni1Q9WUZ5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnni1Q9WUZ5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnni1Q9WUZ5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnni1Q9WUZ5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnni1Q9WUZ5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnni1Q9WUZ5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnni1Q9WUZ5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnni1Q9WUZ5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnni1Q9WUZ5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnni1Q9WUZ5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnni1Q9WUZ5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnni1Q9WUZ5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnni1Q9WUZ5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnni1Q9WUZ5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnni1Q9WUZ5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnni1Q9WUZ5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnni1Q9WUZ5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnni1Q9WUZ5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnni1Q9WUZ5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnni1Q9WUZ5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnni1Q9WUZ5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms