Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU84

Ccs, Copper chaperone for superoxide dismutase, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsQ9WU84 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcsQ9WU84 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcsQ9WU84 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms