Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnfsf13bQ9WU72 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnfsf13bQ9WU72 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfsf13bQ9WU72 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfsf13bQ9WU72 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfsf13bQ9WU72 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfsf13bQ9WU72 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfsf13bQ9WU72 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfsf13bQ9WU72 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfsf13bQ9WU72 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfsf13bQ9WU72 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfsf13bQ9WU72 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfsf13bQ9WU72 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfsf13bQ9WU72 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnfsf13bQ9WU72 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnfsf13bQ9WU72 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnfsf13bQ9WU72 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnfsf13bQ9WU72 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfsf13bQ9WU72 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfsf13bQ9WU72 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfsf13bQ9WU72 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfsf13bQ9WU72 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfsf13bQ9WU72 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfsf13bQ9WU72 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfsf13bQ9WU72 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfsf13bQ9WU72 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfsf13bQ9WU72 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfsf13bQ9WU72 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfsf13bQ9WU72 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfsf13bQ9WU72 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfsf13bQ9WU72 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfsf13bQ9WU72 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfsf13bQ9WU72 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfsf13bQ9WU72 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfsf13bQ9WU72 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfsf13bQ9WU72 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfsf13bQ9WU72 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfsf13bQ9WU72 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfsf13bQ9WU72 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfsf13bQ9WU72 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfsf13bQ9WU72 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfsf13bQ9WU72 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tnfsf13bQ9WU72 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tnfsf13bQ9WU72 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnfsf13bQ9WU72 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnfsf13bQ9WU72 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnfsf13bQ9WU72 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnfsf13bQ9WU72 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnfsf13bQ9WU72 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnfsf13bQ9WU72 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnfsf13bQ9WU72 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfsf13bQ9WU72 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfsf13bQ9WU72 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfsf13bQ9WU72 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfsf13bQ9WU72 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfsf13bQ9WU72 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfsf13bQ9WU72 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfsf13bQ9WU72 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfsf13bQ9WU72 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfsf13bQ9WU72 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfsf13bQ9WU72 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfsf13bQ9WU72 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfsf13bQ9WU72 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfsf13bQ9WU72 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfsf13bQ9WU72 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfsf13bQ9WU72 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfsf13bQ9WU72 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfsf13bQ9WU72 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfsf13bQ9WU72 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfsf13bQ9WU72 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfsf13bQ9WU72 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfsf13bQ9WU72 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfsf13bQ9WU72 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfsf13bQ9WU72 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfsf13bQ9WU72 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfsf13bQ9WU72 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfsf13bQ9WU72 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfsf13bQ9WU72 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfsf13bQ9WU72 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfsf13bQ9WU72 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnfsf13bQ9WU72 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnfsf13bQ9WU72 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnfsf13bQ9WU72 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnfsf13bQ9WU72 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnfsf13bQ9WU72 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnfsf13bQ9WU72 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnfsf13bQ9WU72 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnfsf13bQ9WU72 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnfsf13bQ9WU72 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnfsf13bQ9WU72 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnfsf13bQ9WU72 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfsf13bQ9WU72 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfsf13bQ9WU72 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfsf13bQ9WU72 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms